Ihned po uzavření své hráčské kariéry získal křeslo sportovního ředitele pražské Slavie (umístění na žebříčku Top 50 zde).
Košický talent zlákal do Prahy Vlastimil Petržela, kouč tehdy ambiciózních Bohemians. Následovalo angažmá v Liberci a ve Spartě.
Pod trenérem Chovancem ztratil Kisel jisté místo v sestavě, tak vzal zavděk nabídkou australského Sydney. Do Austrálie se vrátil 9 let po OH, na kterých hájil barvy Slovenska. V roce 2009 získal s koučem Lavičkou australský titul.
Po návratu do Česka si vybral nabídku Slavie, která mu slíbila funkcionářskou práci i po skončení kariéry.
Kisel má právnické vzdělání, za A-tým Slovenska odehrál 25 utkání.