Čtyřiatřicetiletý obránce, který odehrál za reprezentaci 103 zápasů, strávil poslední tři sezony ve Fenerbahce Istanbul, kde mu vypršela smlouva. V Atalantě podepsal 9. srpna roční kontrakt.
S třetím týmem uplynulé sezony si chtěl zahrát Ligu mistrů. Podle médií za Škrtelovým odchodem byly neshody s koučem Gian Pierom Gasperinim kvůli tvrdému tréninkovému procesu a také taktice.
V úvodním zápase ligové sezony, který klub z Bergama vyhrál před týdnem nad Spalem 3:2, zůstal Škrtel na lavičce. Před angažmá ve Fenerbahce strávil osm a půl roku v Liverpoolu a slavil s ním anglický Ligový pohár.