Někdejší člen vedení fotbalové Dukly uspěl v květnu 2015 ve volbách, které měly doplnit chybějícího člena výkonného výboru Fotbalové asociace ČR.
Jedno místo za ligu se totiž uvolnilo úmrtím teplického funkcionáře Františka Hrdličky.
Prokešovu kandidaturu osobně podpořil předseda asociace Miroslav Pelta. V Prokešovi vidí záruku rozvoje projektu regionálních mládežnických akademií, jimž jeho oblíbenec začal aktivně šéfovat.
Na starosti má Prokeš na Strahově i mládežnické reprezentace
