Závod končil na Champs-Elysées velkou euforií z napínavého průběhu etap. Jenže na začátku musel přežít největší dopingovou pohromu od aféry týmu Festina, která zasáhla Tour v roce 1998 a poslala cyklistiku do kolen.
V předvečer prologu byli vyloučeni dva velcí favorité, Ital Ivan Basso a Němec Jan Ullrich, kvůli podezření z účasti v dopingovém skandálu ve Španělsku.
Ullrich, vítěz Tour de France v roce 1997 i Basso, vítěz letošního Gira, odmítli, že by se dopustili nějaké nepravosti.
Ullrich byl později vyhozen ze stáje T-Mobile. Z podobných důvodů byl týmem AG2R stažen jezdec Francisco Mancebo, čtvrtý v loňské Tour. Ze startu závodu musel odejít celý tým Astana-Wuerth, vedený Alexandrem Vinokourovem.
Peloton se zúžil z 21 na 20 týmů a ze 189 na 176 jezdců. Závod odstartoval bez pěti elitních jezdců.
"Nebyl to katastrofální start," hájil akci ředitel Tour de France Jean-Marie Leblanc na své závěrečné tiskové konferenci v Paříži. "Byl to pokojný start, zbavený jedovaté atmosféry, která předcházela prologu," tvrdil.
Když byl Floyd Landis korunován králem závodu, byl dotázán, zda by měl nějaké poselství, které by mohl říct k dopingu. Vítěz odvětil: "Dokázali jsme, že se v našem sportu, více než v jakémkoli jiném, dbá na zabránění dopingu a na řešení tohoto problému."
Nicméně rovněž dodal: "Cyklistika má reputaci, které se, jak se zdá, zatím nezbavila."