Jenže hlavní metou pro Koubka měla být kvalifikace evropských pohárů a ideálně postup do Ligy mistrů. Ovšem po venkovním vítězství 2:1 na půdě Maccabi Tel Aviv nedokázali jeho svěřenci doma udržet tento nadějný výsledek, prohráli 0:2 a s milionářskou soutěží se rozloučili už ve 3. předkole.