V sezoně 2012/13 už vedl Spartu znovu Vítězslav Lavička. Současný trenér reprezentační jednadvacítky začal dobře, když se přes rakouskou Admiru a nizozemský Feyenoord probojoval do základní skupiny Evropské ligy, ve které Sparta vypadla až na jaře s Chelsea. V lize ale skončila Sparta znovu druhá, tentokrát za Plzní.
