Vokouna trápilo hned několik vážných zdravotních problémů, které se hodně podepsaly na tom, že skončil kariéru dřív, než by chtěl. V roce 2006 prodělal zánět žil, poté musel na operaci přetržené šlachy na palci levé ruky, v září 2013 podstoupil operaci kvůli odstranění krevních sraženin.