Všechno to začalo tím, že Koubka zcela nečekaně propustila pražská Slavia. Stihl tam deset zápasů z nichž tři vyhrál, tři remizoval a čtyři prohrál. V březnu 2014 vedení zčistajasna oznámilo, že ho ve funkci hlavního trenéra nahradí nizozemský trenér Alex Pastoor.
